Studijní plán je koncipován tak, aby si doktorand doplnil teoretické znalosti z oblasti Aplikované informatiky, získal (prostřednictvím propedeutických předmětů i spolupráce se školitelem a dalšími staršími vědeckými pracovníky) návyky vědecké práce, ale také aby si ujasnil (případně i prakticky vyzkoušel) možnosti a limity uplatnění nově navržených postupů a metod v prostředí praxe. Studium povinně zahrnuje mezinárodní spolupráci a tvorbu recenzovaných vědeckých publikací. Hlavním výstupem je obhájená disertační práce, z níž je zřejmá schopnost samostatné tvůrčí práce a vědecký přínos v oblasti Aplikované informatiky.